Après une première expérience en cabinet de recrutement, Isabelle Quainon est entrée chez Veolia en 1992 en tant que responsable de la formation des cadres à la CGEA (propreté et transport). Puis elle a fait partie de l’équipe qui a créé l’Institut de l’Environnement Urbain, devenu depuis le Campus Veolia. Elle y a notamment assumé la fonction de directrice de la formation de Veolia Transport. En 2003, elle a décidé d’enrichir son parcours d’une expérience très opérationnelle. Elle a dirigé durant trois ans un réseau de transport en Ile de France.
En 2006 elle devient DRH au sein de la région Banlieue de Paris de Veolia Eau VEDIF, poste dans lequel elle a contribué aux travaux ayant conduit au renouvellement du contrat avec le SEDIF. Dans la même période, elle a assumé la coordination RH de la délégation Veolia Ile de France.
En 2011, Isabelle Quainon devient Directrice de la formation et du développement des compétences du groupe, elle est en charge du pilotage de la formation professionnelle du Groupe et de l’animation du réseau mondial des campus Veolia. En 2016, elle est nommée Directrice des Ressources Humaines Adjointe Groupe. Elle est en charge de la gestion des talents, de la gestion des dirigeants, des rémunérations et avantages sociaux, et du SIRH. En 2023, elle est nommée Directrice de la Transformation, de l'Engagement et des Ressources humaines pour la zone Technologies de l'eau.
Au 1er mars 2025, elle est nommée Directrice des Ressources Humaines du Groupe et devient membre du Comité Exécutif.
